关于举办“动物医学前沿论坛”报告（五十三）的通知

报告时间：6月25日（星期三）14:30

报告地点：动物医学院4129报告厅

邀 请 人：刘军 教授

报告题目：Unlocking single cell epigenetic regulation in clinically archived samples

报 告 人：陈兴启，瑞典乌普萨拉大学终身副教授

报告人简介：

陈兴启，2001-2005， 西北农林科技大学本科，2005-2008西北农林科技大学动物医学院发育生物学硕士。2014年获瑞典卡罗琳斯卡医学院医学博士学位，2015年至2018年在美国斯坦福大学从事博士后研究。2019年至2022年任乌普萨拉大学助理教授，2022年10月起晋升为终身副教授。课题组主要致力于单细胞表观遗传学技术的开发，以及癌症发生与转移过程中基因表达调控机制的研究。研究工作获得了克努特与爱丽丝·瓦伦贝里基金会（Knut and Alice Wallenberg Foundation）、瑞典研究理事会（Swedish Research Council）、瑞典癌症协会（Swedish Cancer Society）等机构资助，累计资助经费超过五千万瑞典克朗。在 Nature Methods、Nature Communications、Nucleic Acids Research、Genome Research、eLife 等国际期刊发表论文40余篇。

Abstract: Formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples are the gold standard for tissue preservation in both clinical practice and biomedical research. Chromatin accessibility governs gene expression by modulating the interaction between transcription factors and DNA. Single-cell chromatin accessibility profiling technology, a powerful tool for understanding epigenetic regulation in human disease, is not available for FFPE samples due to extensive DNA damage. To address this technical challenge, we introduce scFFPE-ATAC, an innovative high-throughput single-cell chromatin accessibility assay for FFPE samples. We successfully applied scFFPE-ATAC to clinical FFPE samples stored for 8–12 years。 Overall, scFFPE-ATAC enables high-throughput, high-sensitivity chromatin accessibility profiling in long-term archived clinical and biomedical specimens, paving the way for retrospective epigenetic studies and spatial epigenetic analysis.

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